Cinnamomum kanehirae Hayata（樟科）的完整葉綠體基因組

摘要

本研究展示了樟科植物 Cinnamomum kanehirae (Hayata) 的完整葉綠體基因組，這是第一個被完全測序的樟科植物。基因組總大小為152,700 bp，具有典型的環狀結構，包括一對長度為20,107 bp 的反向重複序列(IRa/b)，由大單拷貝區域(LSC) 和小單拷貝區域(SSC) 分隔開長度分別為 93,642 bp 和 18,844 bp。基因組整體GC含量為39.1%。核苷酸序列與木蘭科鵝掌楸有91%的同源性。總共有 123 個註釋基因，其中包括 79 個編碼基因、8 個 rRNA 基因和 36 個 tRNA 基因。在所有79個編碼基因中，7個基因（rpoC1、atpF、rpl2、ndhB、ndhA、rps16和rpl2）包含1個內含子，而2個基因（ycf3和clpP）包含2個內含子。最大似然系統發育分析表明，C. kanehirae葉綠體基因組與Laurales目Calycanthus fertilis關係密切。