金樟和樟樹培養機制對牛樟芝萜烯生物合成相關基因表現的影響

摘要

牛樟芝這種珍稀食藥用真菌具有巨大的開發潛力。在本研究中，使用Illumina HiSeq 2000對其轉錄組進行定序。將結果重新組裝，得到66,589個unigenes，N50為4413 bp。與公共資料庫相比，Non-Redundant、Gene Ontology、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 資料庫分別註釋了 6,061、3,257 和 2,807 個 unigene。 A.菌絲體中與萜烯生物合成相關的基因。對肉桂進行了分析，乙醯輔酶A合成酶（ACS2和ACS4）、羥甲基戊二酰輔酶A還原酶（HMGR ）、法尼基轉移酶（< i>FTase) 和角鯊烯合成酶(SQS) 在XZJ（C. 樟樹 ）和NZJ（C. 樟樹）中表達上調。此外，ACS5和2,3-氧化角鯊烯環化酶(OCS)在NZJ中高表達，而血紅素IX法尼基轉移酶( IX-FIT )和ACS3在XZJ中顯著表達。透過即時定量逆轉錄PCR證實了ACS1、ACS2、HMGR、IX-FIT、SQS和OCS的差異表達。該研究為進一步探索萜類化合物生物合成的分子調控機制提供了新的思路，為萜類化合物生產的生物技術提供了數據。 ="/zb_users/ upload/2024/12/TMYB_A_2059156_F0001_C.jpg" alt="圖 1." />

圖 1.

不同濃度的…

圖 1.

不同濃度的添加劑對牛樟芝的三萜類化合物。

圖1.不同濃度添加劑對牛樟芝三萜類化合物的影響。

圖2.

非冗餘蛋白質資料庫功能分類...

圖2.

非冗餘蛋白質資料庫功能牛樟芝unigenes的分類。

圖2.牛樟芝unigenes的非冗餘蛋白質資料庫功能分類。

圖 3.

基因本體功能分類...

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來自 unigenes 的基因本體功能分類牛樟芝。

圖3.牛樟芝unigenes的基因本體功能分類。

圖 4.

unigenes 的 KEGG 分類...

圖 4.

牛樟芝 unigenes 的 KEGG 分類肉桂轉錄組。 KEGG：京都百科全書…

圖 4. 牛樟芝轉錄組中 unigenes 的 KEGG 分類。 KEGG：京都基因和基因組百科全書。

圖5.

差異表達基因的維恩圖...

圖5.

差異表達基因的維恩圖 (牛樟芝轉錄組中的DEGs）…

圖5.牛樟芝轉錄組中差異表達基因（DEGs）的維恩圖。每個圓圈中的數字總和代表比較組合中DEG的總數，圓圈的重疊代表比較的兩組之間的共同DEG。

圖6.

轉錄組表達的交互式熱圖...

圖6.

萜類生物合成酶轉錄組表達的交互式熱圖由牛樟芝編碼...

圖 6.由牛樟芝轉錄組編碼的萜類生物合成酶的轉錄組表達的交互式熱圖。

圖7.

差異表達基因的相對表現量...

圖7.

qRT 差異表達基因的相對錶達量-PCR。 (A) ACS1； (B) ACS2； (C)…

圖 7. qRT-PCR 檢測差異表達基因的相對表現量。 (A) ACS1； (B) ACS2； (C) HMGR； (D) IX-FIT； (E) OCS； (F) SQS； qRT-PCR：即時定量逆轉錄PCR。 所有人物 (7)