比較轉錄組分析揭示深層發酵中營養限制誘導牛樟芝孢子形成的調控機制

摘要

牛樟芝是一種珍貴的食藥用蘑菇，具有保肝、抗腫瘤、抗病毒、免疫調節、腸道菌群等多種生物活性規定。然而，A. 的野生子實體。肉桂稀缺且昂貴。基於孢子接種的深層發酵已成為最高效、最受歡迎的A.A.人工培養方法。肉桂。為了補充A.的無性孢子形成機制。利用RNA-seq和RT-qPCR對肉桂進行深層發酵的比較轉錄組學分析，為進一步提高孢子形成提供理論基礎。不同營養條下培養的肉桂菌絲體，揭示營養限制誘導無性孢子形成的調控機制。得到的機制是：在氮飢餓條件下，相應的感測器向areA和tmpA等基因傳遞訊號，並促進其表現。其中AreA對flbD有直接或間接的作用並促進其表達，進一步增強brlA的表達。同時，TmpA對brlA有直接或間接的作用並促進其表現；在碳飢餓條件下，轉運蛋白Rco-3作為葡萄糖感測器，直接或間接向brlA傳遞訊號並促進其表現。 BrlA促進abaA基因的表達，進一步增強wetA基因的表達，而wetA直接導致無性孢子形成並促進孢子成熟;同時，gulC也能促進細胞自溶，提供孢子形成能量與原料。 2024/12/foods-11-02715-g001.jpg" alt="圖1" />

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樣本重複性統計分析...

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樣本重複性及差異表達基因的統計分析。 ( A ): PCA…

圖1 樣本重複性與差異表現基因的統計分析。 (A)：PCA分析； (B)：相關性分析。

圖2

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差異表達基因的GO分類富集分析。

圖2 差異表達基因的GO分類富集分析。

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差異表達基因的iPath 分析。

圖3 差異表達基因的iPath分析。

圖4

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不同營養條款對參與A條件的基因的影響...

圖4 不同營養條款對A條件的影響與 A. cinnamomea 狀況相關的基因。 (A)：A. cinnamomea FluG介導的無性孢子形成相關基因表現的變化； (B)：與本地蛋白質資料庫匹配的肉桂無性孢子形成相關其他基因的表達變化；以肉桂18S rRNA基因為內參，對照組菌絲體為CK。

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提出的營養限制誘導A 分生孢子形成訊號傳導路徑。 肉桂。

圖5 提出的營養限制誘導肉桂分生孢子形成的訊息傳遞路徑。