類似MicroRNA的小RNA預測牛樟芝發育過程

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圖 1. 差異表達

圖1. 野生型子實體與液體培養菌絲體差異表達基因分析

圖1. 野生型子實體與液體培養菌絲體差異表達基因分析A. cinnamomea 的菌絲體。 F：野生型子實體； M：液體培養菌絲體。 (a) 來自 A. cinnamomea RNA-seq 的 unigenes 的散佈圖。 (b) 野生型子實體和液體培養菌絲體中 DEG 分佈的圓餅圖。 FDR＜0.05和倍數變化≥2或≤0.5定義為差異表達。

圖 2. 基因本體分類與 KEGG…

圖2. 野生型子實體與…之間DEG的基因本體分類及KEGG註釋

圖2. 野生型子實體與液體培養之間DEG的基因本體分類及KEGG註釋菌絲體。 MY：液體培養菌絲體中上調的unigenes，FB：野生型子實體中上調的unigenes。 (a)GO註釋。使用blast2GO分析來自DEG的2,282個unigenes以獲得GO術語。 GO術語透過CateGOrizer進行分類，分為三大類。 (b)KEGG註釋。來自 DEG 的 2,282 個 unigene 被提交給 KAAS 以獲得 KEGG 代謝途徑分類。

圖 3. sRNA 的一般特徵… < /p>

圖3. A 中sRNA 和預測miRNA 的一般特徵。 肉桂。

(a) 長度…

圖 3. 肉桂中 sRNA 和預測 miRNA 的一般特徵。 (a) 來自MY 和FB 的sRNA 文庫的總乾淨讀數的長度分佈，(b) 來自MY 和FB 的sRNA 的5' 末端核苷酸頻率，(c) 預測的新型milRNA 的長度分佈，(d) 5' 末端核苷酸頻率預測的新型 milRNA。

圖4. milRNA 的二級髮夾結構…

圖 4. 來自 A 的 milRNA 的二級髮夾結構。 RNAfold預測的cinnamomea。

milRNA…

圖 4. 透過 RNAfold 預測的 A. cinnamomea milRNA 的二級髮夾結構。 milRNA 依前驅來源分類。 milRNA 以粗體紅色標記，讀數如下所列。

圖5. 本研究鑑定出的milRNA…

圖 5. 本研究中經由 Northern blot 鑑定的 milRNA。

圖 5. 本研究中經由 Northern blot 鑑定的 milRNA。

圖 6. DCL- 的 RT-PCR 2 (Contig_799)、QDE-2…

圖6. DCL-2 (Contig_799)、QDE-2 (argonaute 蛋白、Contig_2130)、DCL-1 (Contig_5359) 與18s rRNA…的RT-PCR

圖6.肉桂中DCL-2 (Contig_799)、QDE-2 (argonaute 蛋白，Contig_2130)、DCL-1 (Contig_5359) 和18s rRNA 基因的RT-PCR。