不同木材基質中牛樟芝菌絲體的轉錄組分析

摘要

牛樟芝是一種具有重要經濟價值和應用前景的食藥用真菌，富含萜類、苯類、木脂素、多醣、以及苯醌、琥珀酸和馬來酸衍生物。在這項研究中，A 的轉錄組。 cinnamomea 培養在 Cinnamomum muduliferum (YZM) 的木質基質上，C.樟腦 (XZM) 和C.採用高通量定序技術Illumina HiSeq 2000對金龜子（NZM）進行定序，並採用de novo策略組裝數據，取得78,729個Unigenes，N50為4,463 bp。與公共資料庫相比，大約有 11,435 個、6,947 個和 5,994 個 Unigene 分別被註釋到非冗餘 (NR)、基因本體 (GO) 和京都基因和基因組百科全書 (KEGG)。黑麴菌絲體萜烯生物合成相關基因的綜合分析。肉桂顯示乙醯輔酶A乙醯轉移酶（AACT）、醯基輔酶A脫氫酶（MCAD）、3-羥基-3-甲基戊二醯輔酶A（HMG-CoA）、甲羥戊酸焦磷酸脫羧酶（ MVD）和與其他兩種木材基質相比，NZM 上的異戊烯二磷酸異構酶 (IDI) 顯著較高。類似地，與NZM和XZM相比，YZM上香葉基香葉基轉移酶(GGT)的表達顯著較高，且XZM上法尼基轉移酶(FTase)的表現顯著較高。此外，2,3-氧化角鯊烯環化酶（OCS）、角鯊烯合成酶（SQS）和角鯊烯環氧化酶（SE）的表現在NZM上顯著升高。總的來說，本研究為探索A中萜類生物合成的分子調控機制提供了一個潛在的方法。 cinnamomea。 />

圖1.

菌絲體在不同木材基質上的生長

圖1.

菌絲體在不同木材基質上的生長牛樟芝。 (A) NZM…

圖 1. 菌絲體在牛樟芝不同木材基質上的生長。 (A) NZM 90 d； (B) XZM 90 d； (C) YZM 90 d。

圖2.

牛樟芝三萜含量…

圖2.

牛樟芝三萜含量。數據以平均值表示...

圖 2. 牛樟芝的三萜含量。數據表示為三個生物重複的平均值。 0.05（鄧肯的多範圍測試）。

圖3.

牛樟芝KEGG代謝路徑圖…

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牛樟芝KEGG代謝路徑圖Unigene轉錄組。

圖3.牛樟芝Unigene轉錄組KEGG代謝路徑圖。

圖4.

差異表達基因的維恩圖...

圖4.

差異表達基因的維恩圖牛樟芝轉錄組。 ……

圖 4. 牛樟芝轉錄組中差異表達基因的維恩圖。每個圓圈中的數字總和代表比較組合中差異基因的總數，圓圈的重疊代表兩個對照組之間共有的差異基因。 (A)顯示上調DEG的維恩圖； (B) 維恩圖顯示下調的 DEG。

圖5.

轉錄組互動式熱圖…

圖5.

萜類化合物轉錄組表達交互式熱圖牛樟芝編碼的生物合成酶…

圖 5. 牛樟芝轉錄組編碼的萜類生物合成酶的轉錄組表達的交互式熱圖。每列代表一個實驗樣本（NZM、XZM 和 YZM），每行代表一個基因。高表達水平以紅色顯示。低表達水平以藍色顯示。

圖6.

差異表達基因的相對錶達量...

圖6.

qRT 檢測差異表達基因的相對表現量-PCR。 (A) ACS13； (B) AACT2； (C)…

圖 6. qRT-PCR 檢測差異表達基因的相對表現量。 (A) ACS13； (B) AACT2； (C) ACC1； (D) 航空營運中心； (E) HMG-輔酶A； (F) MVD； (G) 線上觀察系統； (H) SQS； （一）SE； (J) HMGS2； qRT-PCR：即時定量逆轉錄PCR。誤差線表示三個獨立生物重複的標準差。不同字母表示p ＜p時差異顯著。 0.05。